办理乌鲁木齐三类医疗器械许可证的流程大致如下：

准备申请材料：首先需要准备好相关的申请材料，包括《医疗器械注册申请表》、产品质量管理体系文件、产品技术文件、生产许可证、产品质量检验报告等。

提交申请：将准备好的申请材料提交给乌鲁木齐市食品药品监督管理局或相关部门。

审核和评估：相关部门将对申请材料进行审核和评估，确保符合相关法规和标准。

实地检查：可能需要进行实地检查，以核实生产设施、质量管理体系和产品符合性。

审批和颁发：经过审核和评估合格后，相关部门会审批并颁发乌鲁木齐三类医疗器械许可证。

进行监管和更新：持证单位需遵守相关法规和规定，定期进行自查自检，并及时更新证件。

请注意，具体的流程可能会根据不同情况和政策有所调整，建议申请人在办理前与相关部门联系以获得最新的流程要求和指导。